开放阅读框和编码区的区别（开放阅读框）

发布时间：2024-06-16 13:48:02 栏目：综合问答

导读 您好,今天张张来为大家解答以上的问题。开放阅读框和编码区的区别，开放阅读框相信很多小伙伴还不知道,现在让我们一起来看看吧！1、使用说...

您好,今天张张来为大家解答以上的问题。开放阅读框和编码区的区别，开放阅读框相信很多小伙伴还不知道,现在让我们一起来看看吧！



1、使用说明测试过程:当一个基因被识别、其DNA序列被解读时，人们往往仍然无法弄清相应的蛋白序列是什么。

2、这是因为在没有其它信息的前提下，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译 （每条链三种，对应三种不同的终止密码子）。

3、 ORF Finding 针对小基因序列，搜索并报导可能的蛋白质编码区，它检测这六个阅读框架，并寻找以启动子和 终止子为界限的DNA序列，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。

4、ORF Finding 通过如下方式处理您的序列： ·定位六个阅读框上的ORF候选区域 ·对每个候选区域的编码可能性进行评估 ·如果可能性很高，就把该区域作为可能的蛋白质编码区进行报导 编码可能性：是通过从物种训练模拟器收集来的统计数据确定的用。

5、ORF Finding 进行蛋白质编码区的预测，有三步程序。

6、 第一步：延伸无终止密码子的序列，把延伸的片断定位在六个阅读框上；它们是下一步进行 开放式阅读框研究的候选序列。

7、 第二步：用物种hexamer统计表来估算ORF候选区域上蛋白质编码部分编码蛋白质的最大可能性。

8、 第三步：根据序列结构和区域最可能成分来计算蛋白质编码的可能性。

9、　 这种测试利用物种的统计学原理把编码区从非编码区区分出来，其中包括编码蛋白质的最大可能性的估算、3 个过程的测试 和 ORF片断大小的确定。

10、这种测试应用于物种的二次形式,得到一个三个自由度的 chi-square统计量，被称为候选ORF的二次判别式。

11、这个判别式对于编码区趋向于取大值，对于非编码区 趋向于小值，并被固定化，所以非编码区获取的值趋向于小于1。

12、 一般通过第一步和第二步,大约61%的非编码区域产生值小于1的二次判别式。

13、89%的区域的期望值小于2。

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